MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 plasmid pMIC7113.01

Total Repeats: 274

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019739	AG	3	6	34	39	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019739	GATTCA	2	12	3339	3350	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_019739	AAAG	2	8	3361	3368	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019739	CAT	2	6	11253	11258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019739	A	7	7	11265	11271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019739	GATA	2	8	11288	11295	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019739	GCT	2	6	11365	11370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019739	AGC	2	6	11381	11386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_019739	CAG	2	6	11435	11440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_019739	GCC	2	6	11446	11451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_019739	GT	3	6	11471	11476	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019739	CTT	3	9	11652	11660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019739	AAG	2	6	11742	11747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019739	CCAG	2	8	11789	11796	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_019739	GGC	2	6	11885	11890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_019739	TCG	2	6	11940	11945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_019739	TC	3	6	11980	11985	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_019739	ACTG	2	8	11986	11993	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_019739	ACC	2	6	12919	12924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_019739	TAT	2	6	13570	13575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019739	TATTG	2	10	13600	13609	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019739	ATC	2	6	13632	13637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_019739	AAC	2	6	13678	13683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_019739	TAT	2	6	14396	14401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019739	TCC	2	6	14416	14421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_019739	TGT	2	6	14426	14431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019739	A	6	6	14445	14450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019739	ACT	2	6	14510	14515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019739	TCCA	2	8	16594	16601	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_019739	TGC	2	6	19035	19040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_019739	CG	3	6	19078	19083	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_019739	CAA	2	6	19918	19923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_019739	CTC	2	6	20902	20907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_019739	TAG	2	6	20928	20933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019739	CTT	2	6	20970	20975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_019739	AGC	2	6	20981	20986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019739	CTC	2	6	24285	24290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_019739	ATA	2	6	24384	24389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019739	TTAG	2	8	24401	24408	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019739	GCT	2	6	24491	24496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_019739	TGT	2	6	24574	24579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019739	TGC	2	6	24692	24697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_019739	TTG	2	6	24905	24910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019739	TC	4	8	26134	26141	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_019739	ACCTA	2	10	26204	26213	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_019739	ACC	2	6	32748	32753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_019739	ACA	2	6	32770	32775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_019739	TC	3	6	34566	34571	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_019739	TGT	2	6	34621	34626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019739	TTG	2	6	34665	34670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019739	A	6	6	35407	35412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019739	G	6	6	35415	35420	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019739	CTT	2	6	35454	35459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_019739	ACG	2	6	43770	43775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_019739	ATGT	2	8	43805	43812	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019739	AC	3	6	43842	43847	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_019739	TAC	2	6	43869	43874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_019739	TCA	2	6	43923	43928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_019739	GTT	2	6	44087	44092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019739	T	6	6	44292	44297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019739	TAA	2	6	44349	44354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019739	AAAG	2	8	44357	44364	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019739	CTTA	2	8	44412	44419	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_019739	ATG	2	6	44463	44468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019739	AAAT	2	8	44520	44527	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019739	AGA	2	6	44541	44546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019739	GAA	2	6	44552	44557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019739	AGG	2	6	44562	44567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019739	A	9	9	44573	44581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019739	AATT	2	8	44630	44637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019739	ATA	2	6	44722	44727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019739	CT	3	6	44732	44737	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_019739	CTCG	2	8	44788	44795	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_019739	A	6	6	44818	44823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019739	AG	3	6	44841	44846	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019739	A	7	7	44859	44865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019739	AT	3	6	44874	44879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019739	CA	3	6	44894	44899	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_019739	TC	3	6	44945	44950	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_019739	TGG	3	9	44966	44974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019739	GAC	2	6	45028	45033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_019739	AGC	2	6	45117	45122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_019739	CA	3	6	45220	45225	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_019739	TAGA	2	8	45251	45258	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019739	AAAG	2	8	45292	45299	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019739	C	7	7	45318	45324	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
87	NC_019739	GAC	2	6	45376	45381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_019739	T	6	6	45495	45500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019739	T	7	7	45532	45538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019739	T	7	7	45542	45548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019739	ACA	2	6	45558	45563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_019739	T	6	6	45571	45576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019739	AAC	3	9	45615	45623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_019739	ATT	3	9	45632	45640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019739	GTT	2	6	45670	45675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019739	GTA	2	6	45704	45709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019739	TGA	2	6	47813	47818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019739	TGA	2	6	47821	47826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019739	TGC	2	6	47875	47880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_019739	ACG	2	6	48011	48016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_019739	CCT	2	6	49036	49041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_019739	T	6	6	49117	49122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019739	TCAC	2	8	49218	49225	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_019739	CAT	2	6	49226	49231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_019739	AAGT	2	8	49449	49456	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019739	TAA	2	6	49501	49506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019739	A	6	6	49524	49529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019739	TTTTC	2	10	49530	49539	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_019739	CTG	2	6	50364	50369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_019739	AATT	2	8	50460	50467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019739	AAG	2	6	51088	51093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019739	TCA	2	6	52212	52217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_019739	TGA	2	6	52228	52233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019739	CTA	2	6	52242	52247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_019739	A	6	6	52275	52280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019739	A	6	6	52776	52781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019739	TTAAT	2	10	53003	53012	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019739	AAT	2	6	53015	53020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019739	GAT	2	6	54622	54627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019739	AGA	2	6	54636	54641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019739	TTCT	2	8	54679	54686	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_019739	GAGTT	2	10	54747	54756	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019739	AGA	2	6	62456	62461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019739	TGAAA	2	10	62524	62533	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019739	GCC	2	6	64673	64678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_019739	GTT	2	6	64679	64684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019739	AG	3	6	65704	65709	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019739	TTAA	2	8	65719	65726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019739	TTG	2	6	70039	70044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019739	GAA	2	6	70060	70065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019739	T	6	6	70104	70109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019739	TAA	2	6	71925	71930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019739	TTAA	2	8	72678	72685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019739	CT	3	6	72735	72740	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_019739	A	6	6	72793	72798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019739	CTG	2	6	72818	72823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_019739	AAC	2	6	72887	72892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_019739	CT	3	6	74015	74020	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_019739	GCA	2	6	74032	74037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_019739	TAA	2	6	75604	75609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019739	AGTC	2	8	75623	75630	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_019739	TGA	2	6	75712	75717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019739	CTT	2	6	75725	75730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_019739	AAC	2	6	75819	75824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_019739	TCA	2	6	76470	76475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_019739	TAGA	2	8	76482	76489	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_019739	A	6	6	146020	146025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_019739	TGACA	2	10	146030	146039	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.